基于长读长测序揭示FLG基因3号外显子广泛拷贝数变异并解析特应性皮炎罕见功能丧失性突变
Long-read sequencing of FLG identifies extensive copy number variation in exon 3 and detects rare loss-of-function variants
研究利用长读长测序(Long-Read Sequencing)突破了丝聚蛋白(FLG)基因3号外显子高度串联重复导致的基因分型技术瓶颈,精准解析了FLG的大规模拷贝数变异(CNV)与罕见功能丧失性(LOF)突变。研究不仅发现了1个全新LOF变异和20个长度差异高达13 kb的新等位基因,还揭示了撒哈拉以南非洲人群中非等位基因同源重组驱动的独特等位基因多态性及FLG LOF突变负荷的显著种族异质性。
基于多国跨种族临床队列与公共基因组数据库的遗传学测序与生物信息学研究,临床样本量 N=192(涵盖比利时、爱尔兰及卢旺达来源人群)
表皮物理屏障与终末分化轴(FLG/Filaggrin、角质形成细胞包膜),涉及非等位基因同源重组(NAHR)介导的基因组结构变异及LOF截短变异导致的表皮屏障缺陷与经表皮水分丢失(TEWL)增加。
研究利用长读长测序(Long-Read Sequencing)突破了丝聚蛋白(FLG)基因3号外显子高度串联重复导致的基因分型技术瓶颈,精准解析了FLG的大规模拷贝数变异(CNV)与罕见功能丧失性(LOF)突变。研究不仅发现了1个全新LOF变异和20个长度差异高达13 kb的新等位基因,还揭示了撒哈拉以南非洲人群中非等位基因同源重组驱动的独特等位基因多态性及FLG LOF突变负荷的显著种族异质性。